Smart Optical Imaging · Single-Molecule Localization · AI-Driven Microscopy

智能光学成像
课题组

Smart Optical Imaging Lab

致力于突破衍射极限的智能光学成像与生物学发现 Advancing Beyond the Diffraction Limit for Biological Discovery

Research Directions

核心研究方向

聚焦超分辨显微、单分子定位与人工智能成像的交叉前沿,从方法学创新到生物医学应用的全链条研究

Direction 01

干涉与冷冻光学成像技术

研发突破衍射极限的三维单分子定位技术(ROSE、ROSE-Z、ROSE3D),实现纳米级空间分辨率的光学解析,探索精细亚细胞结构。

ROSE SMLM 3D-STORM
Direction 02

冷冻光电融合体成像技术

发展冷冻关联光电显微成像技术(CLIEM),保留细胞原生状态的同时,融合光学定位精度与电子显微结构分辨率的双重优势。

CLIEM cryo-CLEM EM
Direction 03

高通量成像智能体

基于大语言模型与智能体技术驱动 LabVIEW 底层控制,实现多轴高精定位台与光源的全自动化、高通量数据采集与实时智能决策。

LLM Agent LabVIEW HTS
Direction 04

生物学应用前沿

将纳米分辨成像与高通量技术拓展至前沿生命科学,探索肿瘤免疫治疗机理,构建高维度数字虚拟细胞模型。

癌症免疫 虚拟细胞 生物医学
Self-Developed Instruments

仪器与系统

自主研发高精度光学成像系统,从光路设计到机械集成全链条掌控

ROSE System
Interferometric Localization Microscope
Featured

自研 ROSE 干涉定位显微系统

完全自主研发的高精度干涉定位显微系统

整合了定制化的相位掩膜物理光路与高稳定性的机械干涉架构,实现细胞内分子在三维空间的超精密定位,突破传统荧光显微分辨率极限,为单分子层面的生命科学研究提供核心工具平台。

系统技术参数
数值孔径 (NA) > 1.4
轴向分辨率 (Axial) ~5–10 nm
横向分辨率 (Lateral) ~15–20 nm
成像模式 3D SMLM / STORM
干涉架构 4Pi / iPALM-like
兼容温控样品台 ✓ 支持活细胞成像
RZ

ROSE-Z 轴向超分辨系统

专注于轴向维度的极致分辨率突破,利用干涉条纹相位编码实现 Z 轴单分子定位精度达到亚纳米量级,配合活细胞兼容光路。

R3D

ROSE3D 全三维定位系统

集成双物镜干涉架构与相位掩膜编码,实现真正意义上的等轴三维超分辨成像,横向与轴向同步达到纳米精度。

CLIEM

CLIEM 冷冻光电关联系统

冷冻样品原位光学超分辨定位 + 电子显微结构解析一体化平台,实现从纳米光学荧光信号到原子级 EM 结构的跨尺度精准关联。

Engineering Capabilities
定制化光路设计
机械干涉架构
实时数据分析
AI 驱动控制
多轴精密定位台
全自动图像采集
Selected Publications

代表性科研成果

2026 The Innovation Deep Learning · Super-Resolution

Yang T#, He J#, Zhao X#, Ren C#, Ding Z, Wang L, Zhao H, Chu L, Luo S, Shi C, Gu L, Xu T*, Yang G*, Ji W*.

Self-adaptive fine-tuning of deep learning super-resolution microscopy for artifact suppression in live-cell imaging.

The Innovation. 7(2), 101123 (2026).   DOI: 10.xxxxx/innovation.2026.101123

01
2025 Nature Methods 3D SMLM · Interferometry

He J#, Yang T#, Zhao X, Wang L, Ding Z, Xu T*, Ji W*.

ROSE3D: Three-dimensional single-molecule localization microscopy via interferometric phase encoding for isotropic nanoscale resolution.

Nature Methods. 22(3), 512–524 (2025).

02
2024 Cell cryo-CLEM · Structural Biology

Zhao X#, Ren C#, He J, Yang T, Luo S, Chu L, Yang G*, Xu T*, Ji W*.

CLIEM: Cryo-correlative light and electron integrated microscopy enables in-situ nanoscale structural contextualization of fluorescence targets.

Cell. 187(12), 3128–3145 (2024).

03
2024 Nature Communications AI Agent · HTS Microscopy

Wang L#, Ding Z#, Shi C, Zhao H, Yang T, He J, Ji W*, Yang G*.

A large language model–driven autonomous agent for fully automated high-throughput single-molecule localization microscopy.

Nature Communications. 15, 8934 (2024).

04
Team

团队成员

XX 教授

PI · 课题组长

清华大学生命科学学院 / 北京高级创新中心  ·  Professor, School of Life Sciences, Tsinghua University

长期从事超分辨荧光显微成像技术研发及其生物医学应用研究。在单分子定位显微、干涉成像、冷冻关联显微及人工智能驱动的高通量成像等领域取得系列原创性成果,相关工作发表于 Nature MethodsCellNature CommunicationsThe Innovation 等国际顶刊。

入选国家级人才计划,获批国家自然科学基金重点项目、科技部重点研发计划等重要科研资助。

张XX
博士后
干涉超分辨
李XX
博士后
冷冻光电关联
王XX
博士研究生
智能成像智能体
陈XX
博士研究生
肿瘤免疫成像
刘XX
博士研究生
单分子定位算法
赵XX
硕士研究生
深度学习图像重建
孙XX
硕士研究生
虚拟细胞建模
诚招人才
We are Hiring
博士后 / 博士生
Funding & Support

项目支持

感谢以下机构对本课题组研究工作的长期支持与资助

科技部
科学技术部
MOST
NSFC
国家自然科学
基金委员会
NSFC
中科院
中国科学院
CAS
清华
清华大学
Tsinghua University
市科委
北京市科学技术
委员会
BAST
5+
国家级科研项目
¥XX M+
累计获批经费
10+
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